Esta década testemunhou um aumento na popularidade do uso de computadores para fins pessoais, e a emergência da World Wide Web como meio de comunicação, acelerando o processo da globalização. A partir de 1987, tal como em anos anteriores, Mawlana Hazar Imam prosseguiu os seus esforços incansáveis para o progresso espiritual e material do Jamat. O mandato do Imam para melhorar a qualidade de vida está enraizado na ética do Islão, onde todos os Muçulmanos são convocados a cuidar daqueles que são mais vulneráveis na sociedade.
Grande parte do foco do Imam dirigiu-se à Ásia Central, que estava a sofrer transformações marcantes. Após o colapso da União Soviética em 1991, entidades nacionais como o Tajiquistão, Quirguistão, Cazaquistão e Uzbequistão emergiram como Estados-nação independentes. A liberalização da Ásia Central permitiu que o Imamat entrasse em contacto direto com os Jamats da Ásia Central pela primeira vez em décadas. Quando eclodiu a guerra civil no Tajiquistão, as instituições da Rede Aga Khan para o Desenvolvimento estavam presentes para prestar uma ajuda vital. Ao mesmo tempo, o Afeganistão viu-se devastado por um conflito com a União Soviética que durou oito anos, seguido pela tomada de poder dos Talibã no país. O Imamat estabeleceu novas instituições e acordos para prestar assistência humanitária nestes países, e para ajudar a instalar os refugiados.
O Imamat continuou a desenvolver uma variedade de projectos de desenvolvimento, incluindo o Forte Baltit em Hunza, o Parque Al-Azhar em Cairo, e o hotel Zanzibar Serena. Os empreendimentos turísticos da AKDN investiram na fomentação da sustentabilidade e no reforço da capacidade económica das sociedades do mundo em desenvolvimento. Mawlana Hazar Imam presidiu à primeira cerimónia de convocação da Faculdade de Medicina da Universidade Aga Khan em Karachi, um marco importante no empenho da AKU para melhorar a qualidade dos sistemas de saúde no Paquistão. Foram realizados três ciclos do Prémio Aga Khan para a Arquitectura, com cerimónias realizadas no Cairo, em Samarkand e na Indonésia.
Pelas suas contribuições para a sociedade, Hazar Imam recebeu várias distinções por parte de governos, universidades e outras instituições da sociedade civil, incluindo o Instituto de Tecnologia de Massachusetts, a Universidade Brown e a Universidade do País de Gales. Hazar Imam foi também agraciado com a Grande Cruz da Ordem de Mérito pelo Presidente de Portugal pela sua "notável contribuição para a compreensão humana e para o progresso social e económico em diferentes áreas do mundo".
Mawlana Hazar Imam continuou a passar tempo com os seus murids nesta década, visitando os Jamats do Canadá e do Reino Unido, em 1992 e 1994 respectivamente. Também participou na cerimónia do Lançamento da Primeira Pedra do Centro Ismaili, Lisboa em 1996, para estabelecer o que viria a ser o terceiro Centro Ismaili no mundo ocidental. Os próximos anos seriam marcados por futuros desenvolvimentos tecnológicos, e pela crescente má perceção sobre os princípios e a ética do Islão, a nível mundial.
